La Ibogaína tiene afinidad (Ki) destinada a los siguientes sitios en la secuencia de disminución potencia: σ2 (206 nm)> SERT (548,7 nm)> DAT (1.980 nm)> NMDA (2.001 nm)> κ-opiáceos (2.717 nm)> μ- opiáceos (4.362 nm)> σ1 (5.839 nm)> M3 (12.500 nm)> 5-HT2A (14142 nm)> M1 (22486 nm)> M2 (39,409 nm)> D3 (70.000 nm). [42] Adicionalmente tiene afinidad con VMAT, así como los receptores de Nach, entre objetivos alternativos.